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深沪湾自然保护区所发现的海底古森林遗迹主要分布于距海岸100m～200m外，通常水深约2～3m的潮间带，呈三片分布，已发现有60余棵以上。原始直立状态保存良好。据中国科学院华南植物研究所、华南农业大学和福建师范大学地理所等多家单位鉴定，这些海底古森林遗迹以裸子植物油杉为主，夹有皂荚树、桑树、南亚松等多个属种。据多个品种14C同位素年龄测定，其年龄在距今6761±193年至距今7620±130年之间。
保护区以保护已有7000多年历史的海底古森林遗迹为核心，还包括海湾内的牡蛎礁和海岸自然地质地貌、名胜古迹、防风林带以及石圳海岸海蚀变质岩自然剖面。目前，已发现24株古树桩，其中22株在中潮区、2株在低潮区。最大树桩面直径达100厘米，最小为30厘米。树桩露出滩面1—30厘米，时有些被沙淹没，据地震仪测定，古树桩埋藏部分的长度可能为20—25米。
保护区不但具有重大的科学价值，而且还是旅游胜地。保护区气候条件优越，名胜古迹甚多，在其周围有清朝率兵统一台湾名将”施琅博物馆”，有在闽台一带名闻遐尔供奉妈祖娘娘的“深林寺”、“镇海官”、“百公庙”、“崇真殿”、“宝泉庵”，有壁山栈道、烟墩山峰火台、狮峰石刻等。
国务院1992年批准建立的保护湾海底古森林遗迹自然保护区，其保护对象为海底古森林、杜蛎礁、海蚀变质岩等，这种类型的保护区不仅在我国独一无二，即便在世界上也是少有的。
景区概况
景区景点
古牡蛎礁
古牡蛎礁，主要分布于中潮区，礁体长约500m、宽约300m、厚约20～40cm。从壳体分析，主要以长牡蛎、僧帽牡蛎和近江牡蛎为主，直接附着于基岩上，呈原生直立双瓣俱存完整保存下来。根据广州地理所、国家海洋三所、中科院考古研究所和北京大学考古系测得的14C年龄为距今9355年-25800年之间，且大部分样品测得在距今20000-15000年范围内，因此，深沪湾大片古牡蛎生长年代可追溯至25000年-9000年前及晚更新世的最末盛冰期。 牡蛎礁由大小不同的牡蛎壳胶结而成，据测定，牡蛎礁分布在古树桩出露区的南面，两者相距约100米，位于中、低潮区。石圳海岸的大圳山是全国少有的变质混合岩典型剖面，包括各种结晶片岩，斜长角闪岩，变粒岩等。
变质岩地貌
石圳海岸变质岩地貌 石川变质岩区是著名的平潭一南澳变质带的一部份。本区由于地处适宜的地理位置，有利的地貌部位，因此能够比较完整地保存并清楚展示其历经早古生代、中生代、新生代等漫长的地质历史演变过程和所经历的复杂的动力、热力变质作用，使之成为研究该构造带出露最为良好的地点。此外变质岩区由于受海浪、风沙长期作用，形成的诸如浪蚀穴、风蚀壁龛、风动石、象形石等丰富多彩的海岸地貌现象，具有重大的科研价值，也是难得的科普教育基地。
崇真殿
崇真殿 位于深沪镇港阜居，始建于唐，元末迁建今址。1993年按原样翻建，延二层体的排楼山门拾阶而上，直通天井至正殿，构成元代道观建筑风貌。现殿中还保存着一尊宋代的石雕——玄天上帝。
宝泉庵
终于唐代；原有一山门、二殿宇，本为佛教寺院，宋代配祀道教保生大帝，即有“庵官”之称；明嘉靖年间被倭寇烧毁山门和中殿。一九四九年，后殿西厢再遭国民党飞机轰炸。八三年华侨集资重建。现宫中完整地保存着清咸丰十年从台湾学甲随驾分灵而来的木雕保生大帝（大道公）一尊以及同期传入的数百方古汉方（内科、儿科、外科、眼科等）。
百公庙
百公庙建在深沪东胺沙，庙中供一尊“百公”神像。相传建于一百七十多年前。那年古历二月初九，飓风过后，离深沪不远的海面漂浮着一百个尸体。渔民把尸体打捞起来，埋葬在一起，并建小庙以之悼念。
五十四
五十四 在“百公庙”北侧，是渔民出入港口的重地，传说在八十多年前有五十四个渔民打扮的试题漂到此处，故而得名。
研究价值
保护区的建立，可为研究古海洋、古地理、古气候、古植物，研究台湾海峡地质构造与海平面升降运动及太平洋地质板块运动，研究泉州古港海外交通史提供可靠的科学依据。长期以来，福建泉州、晋江一带有过“沉东京，浮福建”的古代传说，且影响深远。海底古森林和壮蛎礁遗迹的严格保护，将有利于深沪湾和台湾海峡的地质构造运动和地震的研究。
相关荣誉
自1986年发现以来，先后于1990年6月被定为县级保护区，1992年被国务院以国函92（166）号文确立为国家级海洋自然保护区。
旅游攻略
气候：亚热带季风气候，建议夏季游览最佳，可观赏到繁茂的红树林。
住宿：如想留宿，可到镇区旅舍，深沪镇区有旅舍，酒店。一半不须预定就能住到。
交通：从泉州、厦门出发都有直达车；从泉州、厦门出发每日都有多班公共汽车可直达。
美食：鱼丸——深沪美食。深沪的鱼丸在整个泉州地区都是很有名的。其特点为：坚韧雪白，不易变质，入口柔润清脆。因为这里所制的鱼丸不但技术较讲究，取料也较纯真。都是用鳗鱼、嘉腊鱼、敏鱼等上等鱼类。大的鱼丸还专用寺香、碎瘦肉作馅。另外，用肉骨清汤和油葱、瘦肉等配煮，熟时，香津适口。
